Din cauza unei contaminari la scara
globala, omenirea este pusa in pericol de disparitie datorita faptului
ca s-au pierdut capacitatile de reproducere. Doi cercetatori, Trevor si
Orin, se hotarasc sa izoleze oamenii ramasi si sa duca specia umana mai
departe cu ajutorul clonarii urmand sa se autocloneze pana in momentul
in care vor gasi solutia pentru ca omul sa se poata reproduce iar. In
momentul in care descopera solutia, Orin nu mai vrea sa intreupa
procesul de clonare si aici intervine Aeon Flux, care descopera acest
lucru si ajutata de Trevor, reuseste sa distruga procesul de clonare in
favoarea reproducerii naturale.